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1.
Rev. habanera cienc. méd ; 20(6)dic. 2021.
Article in English | LILACS, CUMED | ID: biblio-1409424

ABSTRACT

Introduction: Chagas disease is a neglected tropical disease of interest to public health because of its social and economic burden. Identifying infected and sick people with Chagas disease constitutes the first step towards achieving World Health Ooganization's goals for 2020. Objective: To evaluate the reproducibility with gold standard of a rapid diagnostic test for detection of antibodies to T. cruzi; and to propose a diagnostic algorithm for Chagas disease under the point-of-care concept in an area with limited access to health care coverage. Material and Methods: A cross-sectional study was performed to detect antibodies to T. cruzi in 151 indigenous volunteers belonging to three ethnic groups of the Sierra Nevada de Santa Marta, Colombia. Rapid tests-PDR SD BIOLINE Chagas Ab were implemented in the field versus confirmation in the laboratory using two standardized serological methods (ELISAs). Results: The results show that 19,2 percent seroreactivity for T. cruzi was found among the entire population screening. The highest rate of human infection with T. cruzi was detected in the Wiwa community. No significant differences between rapid diagnostic test and the standard techniques (ELISAs) were found. Sensitivity, specificity and concordance for RDT were 100 percent (Kappa: 1,0). Conclusions: The Sierra Nevada de Santa Marta continues to be a hyperendemic area for Chagas disease. The area is difficult to access and has low or no primary health care coverage, making the assessed rapid diagnostic test a useful tool for screening programs and defining treatment and control plans, which represents the first approach at establishing a point-of-care testing strategy for endemic countries for Chagas disease(AU)


Introducción: La enfermedad de Chagas es una enfermedad desatendida de interés en salud pública por su carga social y económica. Identificar personas infectadas y enfermas con el mal de Chagas constituye el primer paso para alcanzar los objetivos de la Organización Mundial de la Salud para el 2020. Objetivo: Evaluar la reproducibilidad de una prueba de diagnóstico rápida para la detección de anticuerpos contra T. cruzi; y proponer un algoritmo de diagnóstico para enfermedad de Chagas bajo el concepto de uso de tecnologías en el lugar de atención en áreas de acceso limitados a los servicios de salud. Materiales y métodos: Se realizó un estudio de corte transversal para la detección de anticuerpos para T. cruzi a 151 indígenas voluntarios pertenecientes a tres grupos étnicos de la Sierra Nevada de Santa Marta, Colombia. Se implementó pruebas rápidas-PDR SD BIOLINE Chagas Ab en campo versus la confirmación en el laboratorio mediante dos métodos serológicos estandarizados (ELISAs). Resultados: Se encontró el 19,2 por ciento de seroreactividad para T. cruzi entre toda la población estudiada. La tasa más alta de infección humana por T. cruzi se detectó en la comunidad Wiwa. No hubo diferencias significativas entre la prueba de diagnóstico rápida y las técnicas estandarizadas (ELISAS). La sensibilidad, especificidad y concordancia para la PDR fue del 100 por ciento (Kappa: 1,0). Conclusiones: La Sierra Nevada de Santa Marta continúa siendo un área hiperendémica para la enfermedad de Chagas. Dado que es un área de difícil acceso, con baja o nula cobertura en atención primaria en salud, la prueba de diagnóstico rápida evaluada se convierte en una herramienta útil como prueba de elección para programas de tamización y definir planes de acción de tratamiento y control, y representa el primer acercamiento de uso de tecnologías en el sitio de atención para el diagnóstico rápido en países endémicos para la enfermedad(AU)


Subject(s)
Primary Health Care , Public Health , Chagas Disease , Diagnostic Tests, Routine , Health Services Accessibility , Cross-Sectional Studies
2.
Rev. colomb. ortop. traumatol ; 35(2): 215-220, 2021. ilus.
Article in Spanish | LILACS, COLNAL | ID: biblio-1378673

ABSTRACT

Introducción Las fracturas de la diáfisis del húmero son frecuentes, con distribución bimodal en la población. El manejo no quirúrgico con inmovilización y brace funcional es considerado como el estándar de oro con algunas complicaciones determinadas que pueden ocurrir de forma temprana o tardía durante el tratamiento. El atrapamiento del nervio radial por el callo óseo con afectación neurológica es un evento raro publicado en la literatura. Materiales y métodos Se describen dos casos de neuroapraxia tardía del nervio radial en pacientes que sufrieron fracturas de trazos simples quienes cumplían criterios para tratamiento no quirúrgico. Se realizó una revisión narrativa de la literatura en bases de datos conocidas buscando casos similares para optimizar el manejo médico. Resultados Se presentan los desenlaces clínicos de los dos casos que fueron intervenidos quirúrgicamente por el mismo cirujano y que compartían los mismos diagnósticos de atrapamiento del nervio radial por callo óseo durante tratamiento inicial no quirúrgico. Se reportan los resultados de la revisión narrativa de la literatura. Discusión La neuroapraxia del nervio radial por atrapamiento en callo óseo en los primeros días de un tratamiento no quirúrgico para fracturas de trazos simples en diáfisis de húmero es una complicación rara pero posible que confirma la necesidad de una vigilancia estricta del paciente y de aclarar dicho evento.


Background Fractures of the shaft of the humerus are frequent, with bimodal distribution in the population. Non-surgical management with immobilization and a functional brace is considered the gold standard with some specific complications that can occur early or late during treatment. The entrapment of the radial nerve by the bone callus with neurological involvement is a rare event reported in literature. Methods Two cases of late radial nerve neuropraxia are described in patients who suffered simple line fractures who met criteria for nonsurgical treatment. A narrative review of the literature in known databases was carried out looking for similar cases to optimize medical management. Results The clinical outcomes of the two cases that underwent surgery by the same surgeon and that shared the same diagnoses of radial nerve entrapment due to bone callus during initial non-surgical treatment are presented. The results of the narrative review of the literature are reported. Discussion Neuropraxia of the radial nerve due to entrapment in bone callus in the first days of a non-surgical treatment for fractures of simple lines in the diaphysis of the humerus is a rare but possible complication that confirms the need for strict monitoring of the patient.


Subject(s)
Humans , Humeral Fractures , Radial Nerve , Fractures, Bone , Humerus
3.
Rev. cuba. salud pública ; 44(4): 169-185, oct.-dic. 2018.
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-978476

ABSTRACT

RESUMEN Este artículo de revisión, resultado de una investigación mayor titulada "Caracterización de la seguridad alimentaria y nutricional en menores que cursan su primera infancia", tiene como objetivo develar la relación existente entre el estado nutricional y el neurodesarrollo en esta fase de la vida del niño, etapa comprendida entre el nacimiento y los 5 años de edad. Se realizó siguiendo lineamientos de la indagación teórica bibliográfica desde la clave hermenéutica. Se seleccionaron 60 artículos correspondientes a los 15 últimos años, con la finalidad de rastrear el abordaje en torno a las temáticas de estado nutricional y neurodesarrollo y su interacción e incidencia en el ciclo vital de la primera infancia. Como resultado se clarifica conceptualmente los términos de estado nutricional, malnutrición, evaluación del estado nutricional y neurodesarrollo infantil. Asimismo, se revisaron las características e implicaciones de los conceptos en el desarrollo del niño y sus procesos adaptativos. En los textos se evidencian puntos de encuentro entre el estado nutricional y neurodesarrollo en la primera infancia, aunque si bien la mayoría de estudios objeto de revisión proponen una relación directa entre los estados nutricionales y el neurodesarrollo en la primera infancia, hay autores que afirman que de existir esa relación, no es tan determinante como algunos de los procesos fisiológicos y endocrinos que se realizan durante este periodo. La invitación es a continuar buscando respuestas alrededor de esta relación. Es posible concluir que el estado nutricional es uno de los factores ambientales implicado en el neurodesarrollo del niño, potencia las habilidades neuronales para un crecimiento equilibrado y, por tanto, se necesita un sustento neurobiológico impulsado por nutrientes para activarlo, lo que poermitiría al niño adquirir habilidades para su adaptación.


ABSTRACT This review article, which is the result of a larger research entitled "Characterization of food and nutritional security in children in early childhood", aims to reveal the relationship between nutritional status and neurodevelopment in this phase of children's life, from birth to 5 years of age. The guidelines of the bibliographic theoretical inquiry from the hermeneutical key were followed when preparing this review. Sixty articles were selected from the last 15 years, in order to track the approach around the topics of nutritional status and neurodevelopment and their interaction and incidence in the life cycle of early childhood. As a result, the terms of nutritional status, malnutrition, evaluation of nutritional status and child neurodevelopment are conceptually clarified. Likewise, the characteristics and implications of the concepts in the development of the child and its adaptive processes were reviewed. These texts show points of encounter between nutritional status and neurodevelopment in early childhood. Although most of the studies reviewed propose a direct relationship between nutritional status and neurodevelopment in early childhood, there are authors who state that if this relationship exists, it is not as determinant as some of the physiological and endocrine processes that are carried out during this period. The invitation is to continue looking for answers around this relationship. It is possible to conclude that the nutritional status is one of the environmental factors involved in the neurodevelopment of children, potentiates the neuronal abilities for a balanced growth and, therefore, a neurobiological sustenance is needed driven by nutrients to activate it, which could allow children to acquire skills for adaptation.

4.
Rev. colomb. anestesiol ; 45(1): 8-14, Jan.-June 2017. ilus, tab
Article in English | LILACS, COLNAL | ID: biblio-900326

ABSTRACT

Introduction: Nuclear magnetic resonance is a technique requiring breath holding or staying still for long periods of time for image acquisition. For this reason, paediatric patients need to be given sedation or anaesthesia, creating additional risks to those found in other areas. Objective: To describe the incidence of adverse events in paediatric patients in the magnetic resonance service with the presence of an anaesthetist. Materials and methods: Descriptive observational study to assess the incidence of adverse events in 4786 patients under 15 years of age taken to magnetic resonance imaging with an attending anaesthetist for sedation or anaesthesia at Instituto de Alta Tecnología Médica between 2010 and 2014. Results: There were 12 adverse events with a rate of 2.5 for every 1000 paediatric patients. Of these, there were 6 serious, 4 moderate and 2 mild adverse events. The proportion of mortality was 0.04%. Conclusion: Performing magnetic resonance imaging studies under sedation or anaesthesia given by an anaesthetist in patients under 15 years of age is safe. However a risk-benefit analysis is required in hospitalized or decompensated patients, in order to assess the best option.


Introducción: La resonancia magnética es una técnica donde se requieren apneas o periodos de inmovilidad considerables para la adquisición de imágenes. Inmovilidad que por condiciones de los pacientes pediátricos son difíciles mantener, requiriendo administración de sedación o anestesia generando riesgos adicionales a los existentes en otras áreas. Objetivo: Describir la incidencia de eventos adversos en pacientes pediátricos en el servicio de resonancia magnética bajo asistencia por anestesiólogo. Materiales y métodos: Estudio observacional descriptivo, donde se valoró la incidencia de eventos adversos en 4786 pacientes menores de 15 años que fueron llevados a resonancia bajo asistencia por anestesiólogo para sedación o anestesia en el Instituto de Alta Tecnología Médica entre los años 2010-2014. Resultados: Se presentaron 12 eventos adversos, con un índice de 2.5 porcada 1000 pacientes pediátricos, de los cuales 6 eventos adversos fueron graves, 4 moderados y 2 leves. La proporción de mortalidad fue del 0.04%. Conclusión: Realizar estudios de resonancia magnética bajo sedación o anestesia por anestesiólogo en pacientes menores de 15 años es seguro, sin embargo en pacientes hospitalizados o descompensados debe hacerse un análisis riesgo - beneficio y valorar la mejor opción.


Subject(s)
Humans
5.
Biomédica (Bogotá) ; 35(spe): 110-119, ago. 2015. ilus, graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-762723

ABSTRACT

Introducción. La exposición a contaminantes como plaguicidas y metales pesados, se asocia a problemas de salud. Diversos estudios revelan la presencia de estos contaminantes en Cali; sin embargo, no existe información sobre las rutas principales de esa exposición y su riesgo implícito. Objetivo. Estimar los riesgos asociados a la exposición a cadmio, plomo y mercurio, y a los plaguicidas ácido 2,4-diclorofenoxiacético y diuron, debida al consumo de agua potable y alimentos en un grupo de población de Cali. Materiales y métodos. Se obtuvieron datos ambientales e información sobre la población, y se valoró el riesgo empleando los modelos de la Environmental Protection Agency (EPA) de los Estados Unidos. Resultados. Las concentraciones de los contaminantes evaluados estuvieron por debajo de las permisibles establecidas por el Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial de Colombia (3 µg/L -1 de cadmio; 10 µg/L -1 de plomo; 1 µg/L -1 de mercurio; 1 µg/L - 1 de ácido 2,4 diclorofenoxiacético; 1 µg/L -1 de diuron). En las muestras de pescado "manteco" ( Peprilus snyderi ), se detectaron concentraciones de cadmio entre 20 y 80 µg/kg -1 por debajo del límite permisible establecido por la Organización Mundial de la Salud (100 µg/kg -1 ). Los resultados de la valoración mostraron que el riesgo cancerígeno y no cancerígeno atribuible a la ingestión de alimentos y de agua potable con presencia de los contaminantes evaluados, estaba por debajo de los valores máximos admisibles según la EPA. Conclusiones. Se cree que los hallazgos sobre contaminantes en estudios anteriores, pueden deberse a eventos puntuales de contaminación y se recomienda vigilar la bocatoma de agua y emitir alertas tempranas. El reporte sobre la presencia de cadmio en las muestras de pescado, sugiere que el control de la calidad de los alimentos por parte de las entidades reguladoras debe mejorar.


Introduction: Exposure to pollutants such as pesticides and heavy metals has been linked to health problems. Several studies have revealed the presence of these contaminants in Cali; however, there is no information available about the main routes of exposure and risk of these contaminants. Objective: To estimate the risk associated with the intake of cadmium, lead and mercury, and pesticides 2,4-D and diuron through the consumption of water and food in a population in Cali. Materials and methods: Population and environmental data were obtained, and a risk assessment was performed using United States Environmental Protection Agency guidelines. Results: The concentrations of the evaluated pollutants were below permissible levels as established by the Colombian Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial (3 µg/L -1 of cadmium; 10 µg/L -1 of lead; 1 µg/L -1 of mercury; 1 µg/L -1 of 2,4 D; 1 µg/L -1 of diuron). Salema butterfish ( Peprilus snyderi ) samples contained levels of cadmium between 20 and 80 µg/kg -1 , which are below the permissible limit set by the World Health Organization (100 µg/kg -1 ). The results of the risk assessment indicated that the carcinogenic and non-carcinogenic attributable risk to population health from the intake of food contaminants was below the maximum level permitted by the United States Environmental Protection Agency. Conclusions: It is believed that the findings in previous studies on pollutants may have been due to specific contamination events; therefore, monitoring and early warning about water intake is recommended. Furthermore, the report of cadmium being found in fish consumed as food suggests the need for quality control by regulators.


Subject(s)
Female , Humans , Male , Cadmium/analysis , Diuron/analysis , Environmental Exposure/analysis , Food Contamination/analysis , Mercury/analysis , /analogs & derivatives , Water Pollutants, Chemical/analysis , Colombia , Risk Assessment
6.
Med. lab ; 21(9/10): 465-482, 2015. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-907791

ABSTRACT

Introducción: los cambios estructurales del cerebro se pueden observar en fases tempranas de la infección por VIH y acelerarse en estadios avanzados, aunque queda por profundizar con más estudios clínicos la relación que pueda existir entre la adherencia al tratamiento antirretroviral y los cambios en los volúmenes de las estructuras cerebrales. Objetivo: identificar los cambios en estructurascerebrales de personas infectadas con VIH por medio de la resonancia magnética y explorar su relación con el tratamiento antirretroviral. Materiales y métodos: se eligieron 2 grupos, cada uno con 16 individuos; el primero conformado por personas infectadas con VIH y tratamiento adherente y el segundo con individuos no infectados (grupo control). Los volúmenes de las estructuras corticales, subcorticales, las regiones superficiales de la sustancia blanca y gris fueron calculados para los dos hemisferios, en los cuales se utilizaron algoritmos automáticos de la plataforma de análisis de imágenesFreeSurfer. Los datos anatómicos de los individuos fueron adquiridos en un equipo de resonancia magnética 3T en el Instituto de Alta Tecnología Médica (IATM), Medellín, Colombia. Resultados: el análisis de las estructuras corticales y subcorticales no arrojó diferencias significativas entre las volumetríasdel grupo control y los individuos infectados con VIH/adherentes al tratamiento. Conclusión: los hallazgos muestran que el cerebro puede estar posiblemente sin alteraciones en sus estructuras corticales y subcorticales en los individuos con VIH adherentes al tratamiento, en primera o segunda línea de tratamiento antirretroviral, y, a la vez, estos resultados pueden aportar nuevas estrategias de neuroprotección ante el autocuidado frente al esquema de tratamento.


Introduction: structural brain changes can be detected in early stages of HIV infection and may be accelerated in advanced stages, however it still important to have more clinic studies for analyze the relationship between the adherence to antiretroviral therapy and changes in the volume of brain structures. Objective: To identify changes in brain structures from HIV subjects by using Magnetic Resonance Imaging (MRI) and to correlate the findings with the antiretroviral treatment. Materials and methods: Two groups with 16 subjects were chosen: a HIV group of subjects with medication adherence and healthy subjects (control group). By using the automatic segmentation software for brain Freesurfer, cortical and subcortical structures volumes as well as grey and white matter surface area were calculated for both brain hemispheres. Data were acquired through 3T MRI scanner in the Instituto de Alta Tecnología Médica (IATM) from Medellin (Colombia). Results: There were not statistically significant differences in cortical and subcortical structures between control group and subjects HIV infected with adherence to treatment. Conclusion: These findings show that subjects infectedwith VIH in first or second line of antiretroviral treatment probably do not have any change on the brain cortical and subcortical structures. In addition, this allows developing new neuroprotection and self-care strategies during the current treatment plans.


Subject(s)
Humans , Antiretroviral Therapy, Highly Active , Brain Mapping , HIV Infections , Magnetic Resonance Imaging
7.
Infectio ; 18(1): 22-27, ene.-mar. 2014. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS, COLNAL | ID: lil-708916

ABSTRACT

Antecedentes : Poco se sabe sobre la neumonitis intersticial linfoidea (NIL) en niños con infección por el virus de inmunodeficiencia humana-1 (VIH-1) Objetivos: Describir las características clínicas y patológicas de NIL en niños infectados por VIH-1 en un centro de referencia para VIH pediátrico en Cali (Colombia). Métodos: Se llevó a cabo una descripción de serie de casos de NIL basados en revisión retrospectiva de historias clínicas de todos los casos de niños con enfermedad pulmonar crónica y LIP confirmada por biopsia entre los años 2001 y 2012. Resultados y conclusiones: Diez de 12 casos con NIL fueron confirmados por biopsia pulmonar. Se observó una respuesta clínica y de función respiratoria luego del tratamiento con prednisona, excepto en un caso que presentó tos persistente. No se encontraron casos de tuberculosis pulmonar (TP) en nuestra serie y el papel de la biopsia pulmonar fue crítico para alcanzar un diagnóstico preciso.


Background: Little is known about Lymphoid Interstitial Pneumonitis (LIP) in children with HIV infection. Aims: To describe the clinical and pathological characteristics of LIP in infected children in a referral center for pediatric HIV in Cali (Colombia). Methods: Case series based on retrospective analysis of clinical charts among HIV-infected children with chronic lung disease and lung-biopsy proven LIP between the years 2001 and 2012. Results and conclusions: 10 of 12 cases of LIP were confirmed by lung biopsy. Significant clinical and respiratory functional improvement was obtained in all cases after prednisone therapy, excepting one child who presented persistent cough. No case of pulmonary TB was detected in our cohort. Lung biopsy was critical to obtain an accurate diagnosis.


Subject(s)
Humans , Child, Preschool , Child , Tuberculosis, Pulmonary , HIV-1 , Lung Diseases, Interstitial , HIV , Antiretroviral Therapy, Highly Active , Pulmonary Disease, Chronic Obstructive , Mycobacterium tuberculosis
8.
Acta biol. colomb ; 16(1): 95-108, abr. 2011.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-635067

ABSTRACT

La yuca (Manihot esculenta) constituye la base de la alimentación para más de 1.000 millones de personas en el mundo, consolidándose como el cuarto cultivo más importante en el mundo después del arroz, el maíz y el trigo. La yuca es considerada como un cultivo relativamente tolerante a condiciones de estrés abiótico y biótico; sin embargo estas características se encuentran principalmente en variedades no comerciales. Las estrategias de mejoramiento genético convencional o mediadas por transformación genética representan una alternativa para introducir las características deseadas dentro de las variedades comerciales. Un paso fundamental con miras a acelerar los procesos de mejoramiento genético en yuca requiere el descubrimiento de los respectivos genes relacionados con las características buscadas, para lo cual los ESTs (del inglés Expressed Sequence Tags) son una vía rápida para este fin. En este estudio se realizó un análisis de la colección completa de ESTs disponibles en yuca, representada por 80.459 secuencias, los cuales fueron ensamblados en un conjunto de 29.231 genes únicos (unigen), representado por 10.945 contigs y 18.286 singletones. Estos 29.231 genes únicos pueden representar cerca del 80% de los genes del genoma de yuca. Entre el 5 y 10% de los unigenes de yuca no presentaron similitud con las secuencias presentes en las bases de datos de NCBI y pueden constituir genes específicos de yuca. A un grupo de secuencias del set unigen (29%) fue posible asignarles una categoría funcional de acuerdo al vocabulario Gene Ontology. El componente función molecular es el mejor representado con 43% de las secuencias, seguido por el componente proceso biológico (38%) y finalmente el componente celular (19%). Dentro de la colección de ESTs de yuca se identificaron 3.709 microsatélites que podrán ser empleados como marcadores moleculares. Este estudio representa una contribución importante al conocimiento de la estructura genómica funcional de la yuca y se constituye en una herramienta para la identificación de genes asociados a características de interés agrícola para posteriores programas de mejoramiento genético.


Cassava (Manihot esculenta) is the main source of calories for more than 1,000 millions of people around the world and has been consolidated as the fourth most important crop after rice, corn and wheat. Cassava is considered tolerant to abiotic and biotic stress conditions; nevertheless these characteristics are mainly present in non-commercial varieties. Genetic breeding strategies represent an alternative to introduce the desirable characteristics into commercial varieties. A fundamental step for accelerating the genetic breeding process in cassava requires the identification of genes associated to these characteristics. One rapid strategy for the identification of genes is the possibility to have a large collection of ESTs (Expressed Sequence Tag). In this study, a complete analysis of cassava ESTs was done. The cassava ESTs represent 80,459 sequences which were assembled in a set of 29,231 unique genes (unigen), comprising 10,945 contigs and 18,286 singletones. These 29,231 unique genes represent about 80% of the genes of the cassava’s genome. Between 5% and 10% of the unigenes of cassava not show similarity to any sequences present in the NCBI database and could be consider as cassava specific genes. A functional category was assigned to a group of sequences of the unigen set (29%) following the Gene Ontology vocabulary. The molecular function component was the best represented with 43% of the sequences, followed by the biological process component (38%) and finally the cellular component with 19%. In the cassava ESTs collection, 3,709 microsatellites were identified and they could be use as molecular markers. This study represents an important contribution to the knowledge of the functional genomic structure of cassava and constitutes an important tool for the identification of genes associated to agricultural characteristics of interest that could be employed in cassava breeding programs.

9.
Acta biol. colomb ; 15(2): 149-168, ago. 2010.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-635015

ABSTRACT

Los microARNs (miARNs) son moléculas pequeñas de ARN utilizadas por los eucariotas como un mecanismo de control de la expresión génica. En plantas los miRNAs están implicados en la regulación de distintos aspectos del crecimiento y desarrollo, así como en la tolerancia a estrés biótico y abiótico. Muchos miARNs de plantas se encuentran conservados en todos los grupos de embriófitos, sin embargo aún existen muchas plantas para las que no se conoce el reportorio de miARNs. Asimismo se desconoce el papel que algunos miARNs pueden tener en procesos como defensa contra patógenos. En este trabajo se construyó una librería de ARNs pequeños a partir de muestras de tejidos de Manihot esculenta (yuca) inoculados con la bacteria fitopatógena Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam), y se secuenciaron utilizando técnicas de secuenciación de nueva generación (Solexa/Illumina). Se identificaron en la librería 47 familias de miARNs de yuca conservados en otras plantas. Se cuantificó la expresión de estos miARNs, encontrándose similitudes con perfiles de expresión en otras plantas. Se encontró la secuencia de los precursores para algunos miARNs en secuencias de ESTs y GSSs de yuca. Asimismo se predijeron los blancos de estos miARNs en el set de ESTs encontrándose que muchos miARNs están dirigidos contra factores de transcripción, y que existe un gran porcentaje de posibles blancos con función desconocida. Este trabajo es el primer paso hacia entender cómo la vía de miARNs puede estar implicada en la interacción planta-patógeno en el sistema M. esculenta-Xam.


microRNAs (miRNAs) are small RNA molecules used by eukaryotes as a control mechanism for gene expression. In plants, miRNAs play a regulatory role in the expression of various genes involved in growth and development, as well in biotic and abiotic stress tolerance. Many plant miRNAs are conserved in all land plants; however the repertoire of miRNAs is still unknown for many plant species. Likewise, the role for some plant miRNAs in pathogen defense is also unknown. In this work we constructed a library of small RNA from tissues of Manihot esculenta (Cassava) infected with the pathogenic bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). The small RNAs were sequenced using next-generation sequencing (Solexa/Illumina). We identified 47 conserved miRNAs families in Cassava and quantified their expression, finding similarities with expression profiles from other plants. We found sequences for the precursors of some of these families in sets of ESTs and GSSs. We also predicted targets for these miRNAs in a set of ESTs, finding many miRNAs targeting transcription factors, and regions with unknown function. This work constitutes a first step towards understanding the role of the miRNA pathway in plant-pathogen interaction in the M. esculenta-Xam pathosystem.

10.
Rev. colomb. cir ; 20(4): 192-202, oct.-dic 2005. ilus, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-424253

ABSTRACT

Se presenta un estudio experimental que tiene por objetivo evaluar la sensibilidad y especificidad de la detección de solución de continuidad del tracto gastrointestinal con la utilización de partículas pesadas marcadas con Tecnecio 99. Se diseñó un estudio experimental prospectivo triple ciego, con un cálculo de tamaño de muestra teniendo en cuenta una sensibilidad y especificidad superiores al 95 por ciento, con un error alfa del 0.05 y una precisión de 0.05. Inicialmente se evaluaron 4 conejos de la raza Nueva Zelanda para determinar: el anestésico y la dosis a utilizar, la capacidad del estómago en mililitros; los tiempos promedios de tránsito gastrointestinal, la capacidad de la cavidad abdominal en mililitros y la biodistribución del radiofármaco (absorción gastrointestinal, diseminación y distribución hemática y eliminación renal). Se utilizaron 40 conejos de la raza Nueva Zelanda y se analizaron en tres estaciones de trabajo independientes, asignando aleatoriamente 20 conejos en cada grupo de estudio (perforados y no perforados). El radiofármaco utilizado fue Tecnecio 99 sulfuro coloidal > 100 nm, 2.5 mCi a 140 –Kev de energía preparado en una dilución de solución salina al 0.9 por ciento quedando una concentración de 0.0025 mCi por mililitro. El rastreo se realizó con una sonda gamma a 10X. El análisis estadístico se realizó con el programa Episet V:1 aplicando la prueba de Chi Cuadrado.Todos los 20 conejos que tenían disrupción del estómago, presentaron una prueba positiva para detección de radioactividad en el líquido peritoneal analizado con un valor promedio de 467 y un rango de 37 a 1748. En los 20 conejos restantes que no tenían perforación de la pared gástrica la prueba fue negativa.La sensibilidad de la metodología diagnóstica fue de 0.98 y la especificidad de 0.98 con un intervalo...


Subject(s)
Diagnosis , Digestive System Fistula , Radioimmunodetection , Radionuclide Imaging , Radiosurgery
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